Yazar "Koz, Ömer" seçeneğine göre listele
Listeleniyor 1 - 11 / 11
Sayfa Başına Sonuç
Sıralama seçenekleri
Öğe Cycloartane glycosides from Astragalus plumosus var. krugianus and evaluation of their antioxidant potential(Elsevier, 2014) Denizli, Nilufer; Horo, Ibrahim; Gulcemal, Derya; Masullo, Milena; Festa, Michela; Koz, ÖmerThe methanol extracts of Astragalus plumosus var. krugianus Chamb. & Matthews afforded sixteen cycloartane glycosides among which krugianoside A, was never reported before. All compounds were evaluated for their cytotoxic activity in human skin fibroblast WS1 cells. For compounds exhibiting no significant effect on WS1 viability, the antioxidant potential was examined. Compounds 1 and 8 prevented elevation of ROS induced by t-BOOH, suggesting the potential activity of these compounds to protect fibroblasts from oxidative stress. (C) 2013 Elsevier B.V. All rights reserved.Öğe DBU-catalyzed synthesis of novel 2-amino-3-nitrile-4H-chromenes(Walter De Gruyter Gmbh, 2017) Koz, Gamze; Koz, ÖmerA simple method via the base-catalyzed Michael addition of nitroalkanes to 2-iminochromenes was developed, which leads to the production of highly functionalized 2-amino-3-nitrile-4H-chromenes in good yields.Öğe DNA'ya Bağlanma Potansiyeline Sahip Yeni Aminourasil Türevlerinin Sentezi(2019) Koz, Ömer; Halıç, AyseGünümüzde DNA, replikasyon ve transkripsiyon mekanizmalarındaki kritik rolü nedeniyle, antibiyotik, antikanser ve antiviral ilaçların geliştirilmesinde ana hedeflerden biri durumundadır. Kanser, AİDS, Sıtma ve birçok bakteriyel hastalıkta DNA?ya bağlanan ilaçların etkileri bilinmektedir. Bu nedenle biyoorganik kimya alanında yapılan güncel çalışmalar, cisplatin gibi bilinen komplekslerden daha etkili olan ve daha düşük yan etkileri bulunan, potansiyel antikanser ilaç öncüsü olabilecek yeni DNA hedefli bileşiklerin sentezini içermektedir. Urasil, RNA?nın yapısındaki dört nükleobazdan birisidir. 5-aminourasil, güçlü hidrojen bağı oluşturabilme kabiliyeti, laktim-laktam tautomerleri üzerinden sunduğu çok fonksiyonlu yapısı ve türevlendirmeye uygun fonksiyonel grupları nedeniyle DNA bağlanma çalışmaları açısından dikkat çekici bir moleküldür. Grubumuzda yapılan son çalışmalarda, yeni bir 5-arilidenaminourasil (5-AAU) yapısının teorik DNA bağlanma çalışmaları gerçekleştirildi (Şekil 1). Bu ön çalışmalardan elde edilen sonuçların, organik bir molekül için son derece umut verici olduğu belirlendi. Şekil 1. DNA oluklarına bağlanabilen arilidenaminourasil yapısı In silico çalışmalardan elde edilen sonuçlar doğrultusunda benzer arilidenaminourasil bileşikleri sentezlendi ve IR, 1HNMR, 13CNMR ve elementel analiz yöntemleri ile yapı tayinleri gerçekleştirildi (Şekil 2). Şekil 2. Yeni AAU bileşiklerinin sentezi Bu proje sayesinde, farklı elektronik ve sterik etkilere sahip sübstitüentler içeren, toplam 38 adet, yeni, 5- ve 6-arilidenaminourasil bileşiği elde edildi ve in vitro aktivite çalışmaları için hazır hale getirildi.Öğe Enantioselective synthesis of 2-amino-4-(nitromethyl)-4H-chromene-3-carbonitriles from 2-iminochromenes(Taylor & Francis Inc, 2016) Koz, Gamze; Koz, Ömer; Coskun, NecdetA series of medicinally important 2-amino-4-(nitromethyl)-4H-chromene-3-carbonitriles were synthesized using enantioselective conjugate addition of nitromethane to 2-iminochromenes. The reactions were performed using L8-Cu (II) catalytic system and moderate to good enantioselectivities (62-88%) and yields (66-96%) were obtained.Öğe GC-MS analysis of apolar extract of Astragalus sibthorpianus(Bursa Teknik Üniversitesi, 2019) Ölmez, Nevin Arıkan; Güleryüz, Gürcan; Koz, ÖmerAstragalus species are widely distributed in Turkey. There are 445 species in the Flora of Turkey. Plenty of species of Astragalus are used in traditional medicine in many countries such as European Countries, Turkey, China, India etc. They are used for treatment of diabetes, nephritis, leukaemia, and uterine cancer. In addition, they are used as an antiperspirant, diuretic, and tonic drug. Astragalus sibthorpianus is endemic to Uludağ mountain in Turkey. In this study for the first time, the chemical composition of n-hexane extract of plant material was investigated using GC-MS. The whole plant material was dried and powdered and macerated with MeOH at room temperature. The concentrated MeOH layer was extracted with n-hexane for the apolar constituents. The crude n-hexane extract was derivatized and identification of each component was exhibited by Wiley library data search.Öğe GC-MS Analysis of N-Hexane Extracts of Turkish Ankyropetalum Species(2017) Koz, Gamze; Koz, ÖmerThe chemical constituents of crude n-hexane extracts of three Ankyropetalum species, Ankyropetalum gypsophiloides Fenzl, Ankyropetalum arsusianum Kotschy Ex Boiss. and Ankyropetalum reuteri Boiss. Et Hausskn. from Turkey was determined using GC-MS analysis. Thirty three components were identified with Palmitic Acid Methyl Ester and Oleic Acid Methyl Ester as the most abundant components.Öğe SAPONARIA PROSTRATA WILLD. SUBSP. ANATOLICA HEDGE (CARYOPHYLLACEAE) BİTKİSİNİN İÇERDİĞİ SAPONİNLERİN BELİRLENMESİ(2014) Koz, Ömer; Uyar, Zafer; Yumitkan, NesrinBitkiler yüzyıllardır çeşitli hastalıkların tedavisinde kullanılmaktadır. Bitki kökenli ilaçlar özellikle 20 yy. başlarından itibaren tıpta artan bir öneme sahiptir. Günümüzde klinik olarak kullanılan ilaçların yaklaşık %25’i bitki kökenlidir. Bitkiler pek çok kimyasal bileşik üretirler ve saponinler bu bileşik grupları içinde en yaygın olarak bulunanlardandır. Saponinler; antifungal, antiviral, anti-HIV, sitotoksik vb. çok çeşitli biyolojik aktivite gösterirler. Saponaria türleri halk arasında sabun otu olarak adlandırılmaktadır. Bitkiden elde edilen saponinlerin köpürmesi ve temizleme özelliği göstermesinden dolayı, hassas kumaşların ve değerli mücevherlerin temizliğinde doğal temizlik malzemesi olarak kullanılır. Ayrıca Türkiye’nin bazı bölgelerinde ve bazı Ortadoğu ülkelerinde bitkiden elde edilen saponinlerin helva ve benzeri tatlıların yapımında kullanıldığı bilinmektedir. Bunların yanında Saponaria türleri halk arasında pek çok rahatsızlığın tedavisinde kullanılmaktadır. Saponaria türleri üzerine yapılan aktivite çalışmaları sonucu bazı türlerin, prostat, göğüs ve kolon kanserine karşı aktivite gösterdikleri, ayrıca antiproliferative (kanser hücrelerinin yayılımını engelleyici), bağışıklığı güçlendirici ve hemolitik aktiviteler gösterdikleri belirlenmiştir. Bu etkilerin bitkide bulunan saponinlerden kaynaklandığı düşünülmektedir. Proje kapsamında çalışılan S. prostrata WILLD. subsp. anatolica HEDGE türü Türkiye’ye Endemik ve nesli tehlike altındaki bitki türlerindendir. Bitki kurutulup, öğütüldükten sonra MeOH ile ekstrakte edilmiş ve hegzan ile muamele edilerek apolar kısımları uzaklaştırılmıştır. Kalan ekstre, RP–18 üzerinden fraksiyonlanmış, saponin içeren fraksiyonlar birleştirilerek açık kolon kromatografisi, prep. HPLC ve Prep. Tabaka Kromatografisi yöntemleriyle toplam 7 saponin ve 1 flavonoid glikozit saflandırılmıştır. Ayrıca bitkinin içerdiği yağ asitleri GC-MS çalışmasıyla belirlenmiştir. Doymamış yağ asitleri (omega-3 ve omega6 ~%55) , doymuş yağ asitlerine (~35) göre daha yüksek bulunmuştur. Literatür verilerine göre, bu çalısma S. prostrata WILLD. subsp. anatolica HEDGE üzerine yapılmış ilk çalışmadır.Öğe Semi-Purified Saponins of Holothuria poli Associated Antiproliferation in Tumor Cell Lines(Routledge, 2022) Mert-Ozupek, Nazli; Basbinar, Yasemin; Uysal-Kilic, Tugba; Koz, Ömer; Ellidokuz, Hulya; Cavas, LeventThe incidence of cancer has exhibited an increasing trend in recent years because of many reasons such as environmental and nutritional factors. There is a great need for the development of new and natural molecules with lower side effects in the therapy of cancer. It was aimed to evaluate the antiproliferative effect of semi-purified triterpene glycosides of Holothuria poli on different human cancer cell lines. The body walls of H. poli as the main sources of saponins were used and the saponin content of the extract was characterized by MALDI-TOF/MS. The antiproliferation activity of the characterized extract was tested on cancer cell lines. The extract showed antiproliferative effect on the studied cancer cell lines. The mass analysis results reveal that Holothurin A is one of the saponins within the extract. The measured IC50 values were found as 31.41 ± 2.20, 77.45 ± 0.23, and 34.79 ± 0.90 µg mL−1 for HT-29, UPCI-SCC-131, and T84 cell lines, respectively. H. poli secretes not only specific saponins but also a cocktail of them. Specific versus. cocktails of the saponins and by also applying organic modification must be studied in further research to understand their mechanisms in the antiproliferation studies since this paper reveals promising results.Öğe Total Phenolic, Flavonoid, Fatty Acid Contents and Cytotoxic, Antioxidant, and Antimicrobial Activities of Hedysarum aucheri(Sciencedomain Int, 2017) Uyar, Zafer; Koz, Ömer; Uyar, Ebru; Arslan, Ulku; Koyuncu, Ismail; Nalbantsoy, AyseIn vitro cytotoxic, antioxidant, and antimicrobial activities along with total phenolic and flavonoid contents of methanol, hexane, dichloromethane, butanol, and aqueous extracts and chemical composition and fatty acids of n-hexane extract from endemic Hedysarum aucheri were determined. The fatty acid content of the n-hexane extract was determined by GC-MS analysis. Twenty-four out of 39 compounds identified as fatty acid methyl esters constitute 84.20% of hexane extract content. Five of 6 major components were fatty acids, namely alpha-linolenic acid (ALA) (32.37%), palmitic acid (24.69%), linoleic acid (LA) (9.16%), stearic acid (7.11%), Arachidic acid (3.14%), and the other one was an acyclic diterpene alcohol called phytol (12.01%). Butanol extract was found to be the richest in flavonoid (66.3 +/- 1.3 mg QU/g DW) and phenolic (122.4 +/- 1.6 mg GAE/g DW) compounds. Antioxidant activities of the extracts were evaluated by Cupric-ionreducing antioxidant capacity (CUPRAC), and ABTS radical scavenging capacity. Butanol extract showed the highest antioxidant activity indicating a strong correlation between flavonoid/phenolic content and antioxidant activity. Also, cytotoxic activities of the extracts were evaluated against a panel of cancer cells (PC3, HeLa, CaCo-2, U-87MG, A549, and MCF-7) and normal cell line HEK293. Dichloromethane extract (DCM) exhibited exceptionally high tumor selective cytotoxicity towards cancer cells with IC50 values varying between 0.64 and 24 mu g/mL while not impairing the normal cells. DCM extract was found to possess higher cytotoxic activity towards the tested cancer cells than some anticancer drugs reported in the literature. Also, antimicrobial activities of the extracts were determined by agar disc diffusion and the micro-dilution methods against a series of microorganisms and hexane extract showed the highest antimicrobial activity. We hereby report both the pharmaceutical potential of H. aucheri concerning its various biological activities and the phytochemical composition regarding its total flavonoid, phenolic, and fatty acid content.Öğe Türkiye' de yayılış gösteren Pseudevernia furfuracea, Evernia prunastri, Letharia vulpina likenlerinin içerdiği doğal bileşiklerin izolasyonu, yapı tayini ve fotokimyasal özelliklerin incelenmesi(2002) Kırmızıgül, Süheyla; Anıl, Hüseyin; İçli, Sıddık; Koz, Ömer; Zeybek, UlviÇalışmada, Türkiye likenlerinden Pseudevernia furfuracea,Evernia prunastri ve Letheria vulpina'nın içerdiği doğal bileşikler belirlenmiş, serbest ve bağlı karbonhidratlar bulunmuş,yapısı belirlenen bileşiklerden uygun olanların fotokimyasal özellikleri incelenmiş ve MeOH ekstrelerinin biyolojik aktiviteleri araştırılmıştır. Kimyasal ve spektroskopik yöntemlerle,2'si yeni, 3 major bileşikle, 2'si ilk kez rastlanan 34 uçucu bileşik tanımlanmış, bazılarının fotoaktif maddeler olarak kullanılabileceğini saptanmıştır. Özellikle Evernia prunastri ve Letheria vulpina'nin aktivite sonuçları mücadelesi zor mikroorganizmalara karşı etkili bileşikler içerdiklerini göstermiştir.Öğe Yeni Urasil Türevlerinin Aktivite Yönlendirmeli Sentezi(2021) Koz, Gamze; Koz, Ömer; Telli, Fatma; Doğan, Berkay; Bulut, ZaferGrubumuzda yapılan güncel çalışmalar, in silico molekül modellemeleri ile DNA?ya bağlanma potansiyellerinin yüksek olduğu belirlenen küçük organik moleküllerin sentez, yapı tayini ve anti kanser aktivite çalışmalarını içermektedir. Son projemizde, bu yaklaşımla tasarlanan yeni urasil türevi Schiff bazlarının (5AAU) sentez ve yapı tayini gerçekleştirilmiştir. 5-aminourasil ve 5,6-diamino-1,3-dimetilurasil kullanılarak hazırlanan 38 adet yeni urasil türevinin anti kanser aktivite taraması tamamlanmış ve prostat kanser hücresi (PC3) üzerinde doksorubisinden yaklaşık 4 kat daha etkili olan ve sağlıklı hücrelere (HEK293) 5 kat daha az zarar veren öncü bir molekül belirlenmiştir. Diğer türevlerin de farklı kanser hücre hatlarında değişen oranlarda aktivite gösterdiği saptanmıştır. Bu araştırmadan elde ettiğimiz sonuçlara göre, anti kanser aktivitesi en yüksek olan bileşiğin, aynı zamanda organik çözücülerdeki çözünürlüğü en yüksek türev olduğu belirlenmiştir. Bu proje kapsamında, anti kanser aktivite çalışmalarından elde ettiğimiz verilerin yönlendirmesi ile benzer moleküllerin, su ve yaygın organik çözücülerde daha yüksek çözünürlüğe sahip olması beklenen yeni 5,6-diamino-1,3-dimetilurasil türevlerinin hazırlanması ve yapı tayininin yapılması planlanmıştır. Bu plan dâhilinde 2 farklı bileşik grubunun sentezi gerçekleştirilmiştir. Hedef urasil türevleri Proje kapsamında 14 adet şeker türevi ariliden urasil ve 10 adet urasil amin bileşiği hazırlanmıştır. Spektroskopik yöntemler ve elementel analiz ile bileşiklerin yapı tayini gerçekleştirilmiştir. Yapılan çözünürlük taramalarında sentezlenen türevlerin yaygın organik çözücüler ve suda, 5AAU türevlerinden daha yüksek oranda çözündüğü belirlenmiştir. Sentezlenen moleküllerin her biri, alt yapısı kendi laboratuvarımızda oluşturulan yeni moleküllerdir. İleri aktivite çalışmalarına yön verecek çeşitlilikte sübstitüentlere sahip küçük ligandlardır. Bileşiklerin biyolojik aktivite çalışmaları devam etmektedir.
