DeepTFBS: Transkripsiyon Faktörü Bağlanma Bölgeleri Tahmini İçin Derin Öğrenme Yöntemleri Kullanan Hibrit Bir Model

Basit Öğe Kaydı
dc.contributor.authorHatipoğlu, Ayşegül
dc.contributor.authorAltuntas, Volkan
dc.date.accessioned2026-02-08T15:08:15Z
dc.date.available2026-02-08T15:08:15Z
dc.date.issued2025
dc.departmentBursa Teknik Üniversitesi
dc.description.abstractMoleküler seviyede genetik verinin oluşum, aktarım ve düzenlenme süreçleri anlaşılması zor karmaşık kombinasyonel süreçlerden oluşmaktadır. Bu süreçlerin temelini oluşturan transkripsiyon faktörleri genetik bilginin DNA'dan RNA'ya kopyalanmasını sağlayarak hücrelerin özellik ve fonksiyonlarını belirlemede kritik rol oynar. Özellikle sinir sistemi gibi karmaşık yapıları kontrol eden transkripsiyon faktörleri, gen ifadesini düzenleyerek hastalık, sağlık gibi durumların belirlenmesinde hayati rol oynarlar. Proteinlerin DNA üzerinde bağlandıkları bölgeler, gen ifadelerinin kritik noktalarını belirler ve hücrelerin çeşitli koşullara uyum sağlamasına katkıda bulunur. Genetik hastalıkların teşhis edilmesi ve tedavi edilmesi süreçleri için önemli bir adım olan transkripsiyon faktörü bağlanma bölgelerinin tahmini amacıyla literatürde çeşitli yöntemler geliştirilmiştir. DNA’nın dizi ve şekil özelliklerinin beraber kullanımıyla başarılı sonuçlar elde edilen çeşitli çalışmalar geliştirilmiştir. Bu çalışmada DNA dizileri ve şekillerine dayalı olarak transkripsiyon faktörü etkileşimlerini belirlemek için farklı derin öğrenme teknolojileri birleştirilerek hibrit bir yöntem önerilmiştir. Çalışmada 165 doğrulanmış CHIP-Seq veri kümesi kullanılmıştır.
dc.identifier.doi10.2339/politeknik.1509329
dc.identifier.endpage1099
dc.identifier.issn1302-0900
dc.identifier.issn2147-9429
dc.identifier.issue4
dc.identifier.startpage1089
dc.identifier.trdizinid1357374
dc.identifier.urihttps://doi.org/10.2339/politeknik.1509329
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12885/4885
dc.identifier.volume28
dc.indekslendigikaynakTR-Dizin
dc.language.isotr
dc.relation.ispartofPoliteknik Dergisi
dc.relation.publicationcategoryMakale - Ulusal Hakemli Dergi - Kurum Öğretim Elemanı
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.snmzKA_TR-Dizin_20260207
dc.subjectDerin Öğrenme
dc.subjectTranskripsiyon Faktörü
dc.subjectTranskripsiyon Faktörü Bağlanma Bölgeleri
dc.titleDeepTFBS: Transkripsiyon Faktörü Bağlanma Bölgeleri Tahmini İçin Derin Öğrenme Yöntemleri Kullanan Hibrit Bir Model
dc.typeArticle

Dosyalar

Koleksiyon

TR-Dizin İndeksli Yayınlar Koleksiyonu