RNA m6A Modifikasyon Bölgelerinin Sınıflandırılması için Öznitelik Çıkarma ve Boyut Azaltma Yöntemlerinin Karşılaştırılması

Küçük Resim Yok

Tarih

2025

Dergi Başlığı

Dergi ISSN

Cilt Başlığı

Yayıncı

Erişim Hakkı

info:eu-repo/semantics/openAccess

Özet

Bu çalışmada RNA’da sıklıkla meydana gelen N6-metiladenozin (m6A) modifikasyon bölgelerinin belirlenmesi ve gelecekte yapılacak çalışmalar için farklı öznitelik çıkarıcılar, öznitelik seçiciler ve boyut düşürme algoritmalarının, K-en yakın komşu sınıflandırma algoritması kullanılarak performanslarının karşılaştırılması amaçlanmıştır. 35 farklı öznitelik çıkarma algoritması ve 9 farklı boyut azaltma ve öznitelik seçici algoritma kullanılarak algoritmaların m6A modifikasyon bölgelerinin tanımlamasındaki performansları değerlendirilmiştir. Yapılan çalışmanın sonunda Nükleotidlerin kimyasal özelliklerini dikkate alarak öznitelik çıkarımı yapan NCP öznitelik çıkarma algoritması ile Ekstra Ağaçlar boyut azaltma yönteminin birlikte kullanılmasının m6A modifikasyon bölgelerinin belirlenmesinde yüksek performans gösterdiği görülmüştür.

Açıklama

Anahtar Kelimeler

Öznitelik Çıkarımı, Öznitelik Seçimi, N6-metiladenozin (m6A) bölgeleri, K-En yakın Komşu

Kaynak

Politeknik Dergisi

WoS Q Değeri

Scopus Q Değeri

Cilt

28

Sayı

2

Künye