Yazar "Küçük, İlhan" seçeneğine göre listele

Listeleniyor 1 - 3 / 3
  • Küçük Resim Yok
    Öğe
    Quantum Chemical Studies of 1-Naphthalen-2-yl-ethanone-o-propyl-oxime
    (Bilecik Şeyh Edebali Üniversitesi, 2020) Kaya, Yunus; Küçük, İlhan
    In this work, quantum chemical properties of 1-naphthalen-2-yl-ethanone-O-propyl-oxime (NEOPO) molecule which may be biologically active have been presented as a structural, spectroscopic, electronic and molecular docking. All quantum chemical studies were performed by density functional theory (DFT) with the B3LYP / 6-311++G(d,p) method and basis set. The spectroscopic properties, atomic charges, HOMO-LUMO molecular orbitals, chemical reactivity and molecular electrostatic potential (MEP) were investigated as theoretically. The spectroscopic properties have been supported as experimentally. In addition, the Autodock/Vina program was used for molecular docking studies and the binding free energies were calculated as -27.20 and -34.73 kJ/mol for DNA-molecule and protein-molecule interactions, respectively.
  • Küçük Resim Yok
    Öğe
    Başlıksız
    (Elsevier, 2017) Küçük, İlhan; Kaya, Yunus; Kaya, A. Asli
    (4-Nitro-phenyl)-oxo-acetaldehyde oxime (ninapH) is a type of oxime, which has a oxime and alpha-carbonyl groups. This molecule has been synthesized from literature procedure. The structural properties and conformational behaviors were examined using the density functional theory (DFT) with the B3LYP method combined with the 6-311++G(d,p) basis set. As a result of the conformational studies, the most stable conformer was determined, and then this molecule was optimized with the same basis set. Comprehensive theoretical and experimental structural studies on the molecule have been carried out by FT-IR, NMR and UV-vis spectrometry. The calculated HOMO and LUMO energies show that charge transfer within the molecule. The first order hyperpolarizability and molecular electrostatic potential (MEP) were also performed. The thermodynamic properties (heat capacity, entropy, and enthalpy) of the ninapH have been calculated at different temperatures, 100-1000 K. In addition, the molecular docking studies have been, performed with DNA and protein structures (downloaded from Protein Data Bank). (C) 2017 Elsevier B.V. All rights reserved.
  • Küçük Resim Yok
    Öğe
    Başlıksız
    (Bursa Teknik Üniversitesi, 2019) Küçük, İlhan; Kaya, Yunus
    Bu çalışmada, asetofenon, bromoasetofenon ve 2-asetonaftalin moleküllerinin hidroksilamin hidroklorür ve kloropropan ile reaksiyonları sonucunda üç oksim eter bileşiği, 1-fenil-etanon-O-propil-oksim, 1-(4-bromo-fenil)-etanon-O-propil-oksim ve 1-naftalin-2-il-etanon O-propil-oksim sentezlenmiştir. Sentezlenen moleküllerin yapıları IR ve NMR spektroskopi teknikleri ile aydınlatılmıştır. Moleküllerin sentezinin gerçekleştiğinin en önemli kanıtı, keton moleküllerinde 1700 cm-1 civarında gözlenen karbonil gerilme titreşiminin oksim eter bileşiklerinde kaybolması ve yerine 1660-1600 cm-1 aralığında imin (C=N) bandının oluşmasıdır. Ayrıca, NMR spektrumlarında gözlenen oksim hidrojenlerinin oksim eter bileşiklerinin NMR spektrumlarında gözlenmemesi de moleküllerin oluştuğunu doğrulamaktadır. Sentezlenen ve yapıları önerilen moleküller, Gaussian 09 paket programı ve Yoğunluk Fonksiyonel Kuramı (YFK)/B3LYP kullanılarak modellenmiştir. Literatürde sentezlediğimiz üç molekülün yapısına uygun ve deneysel bağ uzunlukları bilinen 4-[2-5(-etilpridin-2-propil)etoksi]benzaldehit oksim molekülü seçilerek taban küme taraması yapılmıştır. En küçük taban küme, STO 3G ile başlayıp sırayla 3-21G, 6-31G, 6-31G(d,p), 6-31G++(d,p), 6-311G, 6-311G(d,p), 6-311G++(d,p) ve 6-311G++(2d,p) taban kümelerinde optimizasyonları yapılmıştır. Her bir taban küme için seçilmiş bağ uzunlukları tabloya geçirilerek deneysel bağ uzunluklarına en yakın sonucu veren taban küme, 6-311G++(d,p) olarak belirlenmiştir. Sonraki tüm kuramsal çalışmalarda bu taban küme kullanılmıştır. Her üç molekülün konformasyon analizi yapılıp enerji diyagramları çizilerek en kararlı molekül yapıları belirlenmiştir. Moleküllerin bağ uzunluğu, bağ açısı ve dihedral açıları gibi moleküler özellikleri belirlenmiş, spektroskopik (IR, NMR ve UV-Gör. Bölge) özellikleri kuramsal olarak incelenerek deneysel değerler ile karşılaştırılmıştır. Moleküllerin bazı fizikokimyasal özellikleri, atomik yükleri, HOMO-LUMO molekül orbitalleri ve enerjileri, kimyasal potansiyel, yumuşaklık, kimyasal sertlik ve elektrofilik indeks gibi kimyasal parametreleri, potansiyel enerji grafikleri ve termodinamik özellikleri, entalpi, ısı sığası ve entropi değerleri kuramsal olarak incelenmiştir. Deneysel olarak gözlenen ve kuramsal olarak hesaplanan tüm sonuçlar literatür ile uyumlu olup, literatüre kazandırılmıştır. Çıkan sonuçların, bu tür molekülleri çalışan araştırmacılara yol gösterici olacağı düşünülmektedir.